ศูนย์บริหารกลาง มีหน้าที่ความรับผิดชอบดังนี้

1. จัดทำทะเบียนห้องปฏิบัติการ เพื่อใช้เป็นข้อมูลพื้นฐานในการพัฒนาห้องปฏิบัติการของประเทศ
2. ส่งเสริม สนับสนุน และพัฒนาห้องปฏิบัติการทดสอบและสอบเทียบ ผู้จัดโปรแกรมทดสอบความชำนาญห้องปฏิบัติการ และผู้ผลิตวัสดุอ้างอิง โดยให้คำแนะนำทางวิชาการ และเผยแพร่ความรู้ด้านเทคนิคเกี่ยวกับห้องปฏิบัติการรวมทั้งประชาสัมพันธ์และเผยแพร่กิจกรรมงานด้านห้องปฏิบัติการ
3. ประสาน ส่งเสริม สนับสนุน การเชื่อมโยงเครือข่ายความรู้ด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีกับหน่วยงานทั้งในประเทศและต่างประเทศ
4. อบรมและพัฒนาศักยภาพ ผู้ประเมิน อนุกรรมการวิชาการ กรรมการรับรองระบบงานห้องปฏิบัติการ กรรมการรับรองความสามารถห้องปฏิบัติการที่ได้รับการยอมรับ และผู้รับผิดชอบดำเนินงานรับรองระบบงานห้องปฏิบัติการ
5. งานสารบรรณ งานเอกสารต่างๆ งานรับ-ส่งหนังสือราชการร่างโต้ตอบหนังสือราชการ จัดเก็บและค้นหาเอกสารระเบียบ คำสั่งของทางราชการ ระเบียบข้อบังคับ และจัดทำเอกสารต่างๆ
6. งานการเงินและงบประมาณ จัดทำแผน/ข้อมูลงบประมาณบัญชี การเบิก-จ่าย จัดซื้อวัสดุภายในประเทศและต่างประเทศของสำนัก
7. งานบุคลากร ประสานงาน เก็บรวบรวมสถิติข้อมูลของบุคลากร
8. ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้อง

ศูนย์รับรองระบบงานห้องปฏิบัติการ 1 มีหน้าที่ความรับผิดชอบดังนี้

1. ดำเนินการเกี่ยวกับการรับรองระบบงานห้องปฏิบัติการทดสอบทั้งในและต่างประเทศ รวมทั้งดำเนินการประสานงานกับต่างประเทศและองค์การระหว่างประเทศ ด้านสิ่งแวดล้อม และผลิตภัณฑ์อุตสาหกรรม
2. ดำเนินการเกี่ยวกับการรับรองความสามารถห้องปฏิบัติการที่ได้รับการยอมรับตามข้อกำหนดหลักเกณฑ์ วิธีการ และเงื่อนไขของกรมวิทยาศาสตร์บริการ ด้านสิ่งแวดล้อม
3. ติดตามและประเมินผลความสามารถห้องปฏิบัติการทดสอบ
4. พัฒนาและรักษาระบบคุณภาพการดำเนินงานให้เป็นไปตามมาตรฐานสากล
5. ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้อง

ศูนย์รับรองระบบงานห้องปฏิบัติการ 2 มีหน้าที่ความรับผิดชอบดังนี้

1. ดำเนินการเกี่ยวกับการรับรองระบบงานห้องปฏิบัติการทดสอบทั้งในและต่างประเทศ รวมทั้งดำเนินการประสานงานกับต่างประเทศและองค์การระหว่างประเทศ ด้านอาหาร ภาชนะบรรจุอาหาร อาหารสัตว์ และผลิตภัณฑ์อื่นๆ
2. ดำเนินการเกี่ยวกับการรับรองความสามารถห้องปฏิบัติการที่ได้รับการยอมรับตามข้อกำหนดหลักเกณฑ์ วิธีการ และเงื่อนไขของกรมวิทยาศาสตร์บริการ ด้านอาหาร ภาชนะบรรจุอาหาร อาหารสัตว์ และผลิตภัณฑ์อื่นๆ
3. ติดตามและประเมินผลความสามารถห้องปฏิบัติการทดสอบ
4. พัฒนาและรักษาระบบคุณภาพการดำเนินงานให้เป็นไปตามมาตรฐานสากล
5. ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้อง

ศูนย์รับรองระบบงานห้องปฏิบัติการ 3 มีหน้าที่ความรับผิดชอบดังนี้

1. ดำเนินการเกี่ยวกับการรับรองระบบงานห้องปฏิบัติการทดสอบและสอบเทียบทั้งในและต่างประเทศ รวมทั้งดำเนินการประสานงานกับต่างประเทศและองค์การระหว่างประเทศ ด้านผลิตภัณฑ์วัสดุ เคมีภัณฑ์ ยางและผลิตภัณฑ์อื่นๆ ที่เกี่ยวข้อง และอื่นๆ
2. ดำเนินการเกี่ยวกับการรับรองระบบงานผู้จัดโปรแกรมทดสอบความชำนาญและผู้ผลิตวัสดุอ้างอิงทั้งในและต่างประเทศ รวมทั้งดำเนินการประสานงานกับต่างประเทศและองค์การระหว่างประเทศ
3. ดำเนินการเกี่ยวกับการรับรองความสามารถห้องปฏิบัติการที่ได้รับการยอมรับตามข้อกำหนดหลักเกณฑ์ วิธีการ และเงื่อนไขของกรมวิทยาศาสตร์บริการ ด้านผลิตภัณฑ์วัสดุ เคมีภัณฑ์ ยางและผลิตภัณฑ์อื่นๆ ที่เกี่ยวข้อง
4. ติดตามและประเมินผลความสามารถห้องปฏิบัติการทดสอบ
5. พัฒนาและรักษาระบบคุณภาพการดำเนินงานให้เป็นไปตามมาตรฐานสากล
6. ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้อง

โครงสร้างกองบริหารและรับรองห้องปฏิบัติการในระบบบริหารงานคุณภาพ